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技(jì)術(shù)文(wén)獻
如何優化WB實驗(yàn)條(tiáo)件以驗(yàn)證(zhèng)Anti-ACA11抗體(tǐ)
優(yōu)化(huà)WB實(shí)驗(yàn)條件驗(yàn)證Anti-ACA11抗(kàng)體,需圍繞(rào)ACA11蛋白(分子量112kDa,植物膜定位(wèi)鈣轉(zhuǎn)運蛋白)特(tè)性針對性調整(zhěng),具(jù)體(tǐ)方(fāng)案(àn)如(rú)下:
一(yī),樣(yàng)品製(zhì)備環節優(yōu)化
裂解(jiě)條件(jiàn):擬(nǐ)南芥樣本(běn)全程冰上(shàng)操作,使用(yòng)含(hán)蛋白(bái)酶(méi)抑(yì)製(zhì)劑的(dí)RIPA裂解(jiě)液裂解30分(fēn)鐘,期間間(jiān)歇渦旋(xuán)混(hùn)匀,之後4℃,12000g離(lí)心15分(fēn)鐘取(qǔ)上清(qīng),避(bì)免(miǎn)蛋白降解。
上(shàng)樣量調(tiáo)整(zhěng):為(wéi)了(liǎo)驗證抗(kàng)體有(yǒu)效(xiào)性,可設置(zhì)梯度上樣量(liáng):10μg,30μg,50μg總(zǒng)蛋(dàn)白,便(biàn)於觀察(chá)不(bù)同(tóng)蛋(dàn)白濃(nóng)度下的條帶情況,常規(guī)驗證推薦(jiàn)30μg總(zǒng)蛋(dàn)白上樣。
變(biàn)性(xìng)處(chǔ)理(lǐ):使(shǐ)用含(hán)DTT還(huán)原劑的上樣緩衝(chōng)液,95℃加(jiā)熱(rè)變(biàn)性5-10分(fēn)鐘,確保蛋白(bái)充分(fēn)變性(xìng),保證(zhèng)抗(kàng)體識(shí)別位點暴(bào)露。
二,電(diàn)泳(yǒng)與(yǔ)轉(zhuǎn)膜條件(jiàn)優(yōu)化
凝膠選擇:ACA11分(fēn)子量(liáng)為112kDa,優先(xiān)選擇8%分(fēn)離膠(jiāo)的SDS-PAGE膠(jiāo),可(kě)保(bǎo)證大(dà)分(fēn)子量蛋白(bái)充(chōng)分分離,避免條帶(dài)壓縮(suō)模糊。
轉(zhuǎn)膜參數:推薦恒(héng)流250mA轉(zhuǎn)印75分(fēn)鐘(zhōng),全(quán)程冰浴(yù)降(jiàng)溫防止(zhǐ)蛋(dàn)白降(jiàng)解(jiě);選(xuǎn)擇0.45μm孔徑的PVDF膜(mó),轉(zhuǎn)膜前用(yòng)甲(jiǎ)醇(chún)活(huó)化30秒,提(tí)升(shēng)蛋白(bái)結合能力(lì)。
三,封(fēng)閉(bì)與(yǔ)抗(kàng)體孵育優(yōu)化(huà)
封閉(bì)選擇:優先采(cǎi)用(yòng)5%脫脂(zhī)奶(nǎi)粉(fěn)TBST溶液室(shì)溫(wēn)封閉(bì)1小時;若(ruò)背(bèi)景(jǐng)偏高,換為3%BSA封閉(bì),減(jiǎn)少非(fēi)特異(yì)性結(jié)合(hé)。
抗體濃(nóng)度梯度:驗證時必(bì)須設(shè)置濃度(dù)梯度,推薦(jiàn)設(shè)置(zhì)1:200,1:500,1:1000,1:2000四個稀(xī)釋比(bǐ)例(lì),4℃搖(yáo)床(chuáng)孵育過夜,對(duì)比(bǐ)不(bù)同(tóng)濃度的條帶效果確(què)定(dìng)最佳工(gōng)作濃度(dù)。
二抗(kàng)匹配:Anti-ACA11多為(wéi)兔源(yuán)一(yī)抗,選(xuǎn)擇(zé)HRP標(biāo)記的(dí)羊(yáng)抗(kàng)兔二抗(kàng),稀釋(shì)比(bǐ)例推薦(jiàn)1:5000-1:10000,室溫(wēn)孵育(yù)1小(xiǎo)時即(jí)可。
四(sì),洗(xǐ)滌(dí)與顯影優(yōu)化(huà)
洗(xǐ)滌(dí)操(cāo)作:一(yī)抗,二抗(kàng)孵(fū)育完成後(hòu),均用0.1%TBST洗(xǐ)滌3次,每次(cì)10分鐘,緩慢(màn)搖床(chuáng)振蕩,充(chōng)分洗去未結合的遊離(lí)抗體,降(jiàng)低背景(jǐng)。
顯(xiǎn)影(yǐng)策(cè)略:采用梯(tī)度(dù)曝光(guāng),依次曝光5秒,30秒,2分(fēn)鐘,避免(miǎn)過曝或(huò)曝光(guāng)不足,方便(biàn)準(zhǔn)確(què)判斷(duàn)條帶特異(yì)性。
五(wǔ),驗證(zhèng)對照(zhào)設(shè)置(關(guān)鍵(jiàn))
必須同(tóng)時設置(zhì)兩類對照(zhào)才能(néng)準確驗證(zhèng):
陽性對照(zhào):擬南芥野生(shēng)型樣本,確認抗體(tǐ)能結(jié)合(hé)目標蛋白
陰性(xìng)對(duì)照:aca11敲除突變體或(huò)同(tóng)型IgG替(tì)代一(yī)抗(kàng),排除(chú)非(fēi)特(tè)異(yì)性(xìng)結合(hé)
一(yī),樣(yàng)品製(zhì)備環節優(yōu)化
裂解(jiě)條件(jiàn):擬(nǐ)南芥樣本(běn)全程冰上(shàng)操作,使用(yòng)含(hán)蛋白(bái)酶(méi)抑(yì)製(zhì)劑的(dí)RIPA裂解(jiě)液裂解30分(fēn)鐘,期間間(jiān)歇渦旋(xuán)混(hùn)匀,之後4℃,12000g離(lí)心15分(fēn)鐘取(qǔ)上清(qīng),避(bì)免(miǎn)蛋白降解。
上(shàng)樣量調(tiáo)整(zhěng):為(wéi)了(liǎo)驗證抗(kàng)體有(yǒu)效(xiào)性,可設置(zhì)梯度上樣量(liáng):10μg,30μg,50μg總(zǒng)蛋(dàn)白,便(biàn)於觀察(chá)不(bù)同(tóng)蛋(dàn)白濃(nóng)度下的條帶情況,常規(guī)驗證推薦(jiàn)30μg總(zǒng)蛋(dàn)白上樣。
變(biàn)性(xìng)處(chǔ)理(lǐ):使(shǐ)用含(hán)DTT還(huán)原劑的上樣緩衝(chōng)液,95℃加(jiā)熱(rè)變(biàn)性5-10分(fēn)鐘,確保蛋白(bái)充分(fēn)變性(xìng),保證(zhèng)抗(kàng)體識(shí)別位點暴(bào)露。
二,電(diàn)泳(yǒng)與(yǔ)轉(zhuǎn)膜條件(jiàn)優(yōu)化
凝膠選擇:ACA11分(fēn)子量(liáng)為112kDa,優先(xiān)選擇8%分(fēn)離膠(jiāo)的SDS-PAGE膠(jiāo),可(kě)保(bǎo)證大(dà)分(fēn)子量蛋白(bái)充(chōng)分分離,避免條帶(dài)壓縮(suō)模糊。
轉(zhuǎn)膜參數:推薦恒(héng)流250mA轉(zhuǎn)印75分(fēn)鐘(zhōng),全(quán)程冰浴(yù)降(jiàng)溫防止(zhǐ)蛋(dàn)白降(jiàng)解(jiě);選(xuǎn)擇0.45μm孔徑的PVDF膜(mó),轉(zhuǎn)膜前用(yòng)甲(jiǎ)醇(chún)活(huó)化30秒,提(tí)升(shēng)蛋白(bái)結合能力(lì)。
三,封(fēng)閉(bì)與(yǔ)抗(kàng)體孵育優(yōu)化(huà)
封閉(bì)選擇:優先采(cǎi)用(yòng)5%脫脂(zhī)奶(nǎi)粉(fěn)TBST溶液室(shì)溫(wēn)封閉(bì)1小時;若(ruò)背(bèi)景(jǐng)偏高,換為3%BSA封閉(bì),減(jiǎn)少非(fēi)特異(yì)性結(jié)合(hé)。
抗體濃(nóng)度梯度:驗證時必(bì)須設(shè)置濃度(dù)梯度,推薦(jiàn)設(shè)置(zhì)1:200,1:500,1:1000,1:2000四個稀(xī)釋比(bǐ)例(lì),4℃搖(yáo)床(chuáng)孵育過夜,對(duì)比(bǐ)不(bù)同(tóng)濃度的條帶效果確(què)定(dìng)最佳工(gōng)作濃度(dù)。
二抗(kàng)匹配:Anti-ACA11多為(wéi)兔源(yuán)一(yī)抗,選(xuǎn)擇(zé)HRP標(biāo)記的(dí)羊(yáng)抗(kàng)兔二抗(kàng),稀釋(shì)比(bǐ)例推薦(jiàn)1:5000-1:10000,室溫(wēn)孵育(yù)1小(xiǎo)時即(jí)可。
四(sì),洗(xǐ)滌(dí)與顯影優(yōu)化(huà)
洗(xǐ)滌(dí)操(cāo)作:一(yī)抗,二抗(kàng)孵(fū)育完成後(hòu),均用0.1%TBST洗(xǐ)滌3次,每次(cì)10分鐘,緩慢(màn)搖床(chuáng)振蕩,充(chōng)分洗去未結合的遊離(lí)抗體,降(jiàng)低背景(jǐng)。
顯(xiǎn)影(yǐng)策(cè)略:采用梯(tī)度(dù)曝光(guāng),依次曝光5秒,30秒,2分(fēn)鐘,避免(miǎn)過曝或(huò)曝光(guāng)不足,方便(biàn)準(zhǔn)確(què)判斷(duàn)條帶特異(yì)性。
五(wǔ),驗證(zhèng)對照(zhào)設(shè)置(關(guān)鍵(jiàn))
必須同(tóng)時設置(zhì)兩類對照(zhào)才能(néng)準確驗證(zhèng):
陽性對照(zhào):擬南芥野生(shēng)型樣本,確認抗體(tǐ)能結(jié)合(hé)目標蛋白
陰性(xìng)對(duì)照:aca11敲除突變體或(huò)同(tóng)型IgG替(tì)代一(yī)抗(kàng),排除(chú)非(fēi)特(tè)異(yì)性(xìng)結合(hé)
